Les directions fonctionnelles portent la totalité des responsabilités non médicales au sein de l’établissement.
Elles sont regroupées au sein du pôle management, piloté par le directeur général et travaillent en étroite collaboration avec le secrétariat général et les pôles cliniques.
Depuis le mois d’avril 2016, la plupart de ces directions fonctionnelles sont transversales, c’est à dire communes aux deux établissements publics de santé implantés dans l’ouest du département :
L'Etablissement Public de Santé Mentale de la Réunion (EPSMR) et le Centre Hospitalier Gabriel Martin (CHGM)